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Les fouilles menées de 1991 à 1997 par Michel Reddé et son équipe d'archéologues autour d'Alise-Sainte-Reine permettent de compléter, sur de nombreux points, la récolte de matériel effectuée lors des travaux du XIXe siècle. L'ensemble comprend toutefois très peu de céramique et d'amphores, assez peu d'armes, mais un nombre important de monnaies et une collection unique de petit équipement métallique, pour une large part issue de prospections de surface. Cela s'explique par les conditions et la durée du siège, les méthodes de recherche.

Défense et illustration de la découverte d'André Berthier par Danielle Porte, une des disciples du découvreur. Etude des textes antiques, présentation des témoignages du terrain. Pour l'auteur, le seul récit de la bataille d'Alésia est dicté par César : c'est La Guerre des Gaules. L'histoire étant toujours écrite par les vainqueurs, les Gaulois y apparaissent indisciplinés, au final écrasés grâce au génie militaire du futur dictateur romain malgré des légionnaires en sous-nombre. Le destin de la Gaule est scellé.

Les monuments anthropiques, témoignages cultuels ou religieux sur le site de Chaux-des-Crotenay. Intervention de Danielle Porte au Colloque du 6 février 1998 organisé par l'Association Lemme et Saine d'Intérêt Archéologique à l'Institut Catholique de Paris.

Elisabeth Rabeisen , conservateur du Musée d'Alise-Sainte-Reine, fait en 1999 un inventaire “à la Prévert” et provocateur de tous les sites postulant à être des Alésia (3850 Alésia recensés) . Elle cite successivement Alès, Vernègues, Alaise, Alièze, Château-Chalon, Conliège, Novalaise, Izernore, Authesa, Aluze, Salins, Chaux-des-Crotenay, Ornans, Aloise, Guillon, Auxonne, Luxeuil, Taravan.